南京雨花石因小巧玲珑、质坚细腻、晶莹剔透、色彩斑斓而深受人们的喜爱。特别是其上酷似山川、河流、人物和动植物的图案，更是令人叹为观止。

南京雨花石因而有“江南奇石”之称。据报道，在南京北阴阳营新石器时代遗址出土的近．300件玉石、玛瑙制石，是迄今发现的最早的雨花石藏品。据周德麟考证，在六朝至隋唐的一些文献中就有以雨花石进贡的记载。晚唐懿宗时，雨花石甚至作为同昌公主的陪嫁品之一。两宋时期，雨花石的交易广泛地在民间和士大夫之间进行。南宋时，曾有人用北宋的大画冢崔白横披《鹅》，换一枚水胆雨花石而未成功的传说，足见雨花石的珍贵。明代中晚期，雨花石的收藏、交易更是兴盛，市场上千钱一枚的雨花石不可胜数。明清以来，珍品雨花石的价格非常昂贵，曾有一学生得一“军士肖像石”后拿去典当，得纹银40两。而当时他老师一年的工资才10两纹银。民国时期，雨花石仍是人们收藏、买卖的俏货。1903年，章鸿钊在《宝石说》中写遒：“一雨花石作乌兽状，其价数金。”解放后，雨花石市场一度冷清。改革开放后，人民逐渐富裕起来，雨花石的价格也因此一路飙升，极品的价格竟达几万元，甚至几十万元，真是令人昨舌。现在，南京雨花石远销美、俄、澳、日、意、英、法、香港、澳门、台湾等国家和地区，成了南京的一大品牌。据说，南京附近有一个村，仅2002年销售雨花石的收入就达到1200万元。

有人偶尔在雨花石上见到一两枚纹筛美丽又奇特的图案，感到诧异和不解。于是，向中国科学院南京地质古生物所的专家请教，经古植物专家姚兆琦鉴定，那些中心略具八卦形图案的雨花石，是距今两亿多年前的辉木树茎的横断面，其上还有明显的植物输送水分和养分的维管组织以及细胞的结构，其余是辉木树茎的木质部，茎的四周还常有气根的横断面圆形构造。

解放初期，邪教组织“一贯道”曾拿着一块具有辉木茎八卦图形的雨花石欺骗百姓，说这是神石，是上天赐给他们的八卦图，还要求人们对这些“神石”顶礼膜拜。后来政府取缔了“一贯道”，公安机关曾拿着这块雨花石向专家请教，终于揭穿了他们的鬼把戏。

多年采，江办省地质博物馆的周小丹馆长就非常注意收集有关雨花石方面的资料，并将其制成了光盘。人们突然发现，雨花石中的化石种类竟如此之多，光植物化石就有由非常细小的钙藻和蓝藻组成的叠层石及大的植物化石，如辉木等。动物化石就更多了，有螺蛳、鹦鹉螺(头足类)、珊瑚、海绵、苔藓虫、蚌壳(双壳类)、有孔虫、海百合茎等等。除此之外，还有一些因无法切片，而不能在高倍显微镜下观察的，至今尚未搞清其是否是化石。

雨花石中含化石已很罕见。更奇的是，这些化石竟有不同的颜色，有一些就像一朵朵盛开的花朵，叫人爱不释手。比如辉木气根的横断面，有时竟与珊瑚化石难分伯仲，令古生物专家也惊叹不已。