雨花石的形成必须具备三个条件。

笫一：区域内岩石类型比较多，特別盐类岩石或矿物（灰岩、白云岩、大理岩或方解石、钟乳石、石膏、萤石等）比较发育；区域内金属矿床的品种、类型、数量都很多；区域内具观赏价质的石头或矿物的品种、类型、数量都很多。

第二：区内存在大江大河，流域面积越大，可以汇聚岩石的面积范围才会越大，聚集的岩石砾石种类、数量才会越多，也就是说能夠提供变成雨花石的材料的种类和数量才会越丰富。反之无江河搬运，各地石头就不可能聚集，小江小河只能小范围汇聚，聚集的岩石种类和数量有限，无法和形成雨花石的原岩砾石材枓相比美。

    第三：砾石层形成后，还没有固结成砾岩前，必须有岩漿的火山活动或侵入活动帶来富二氧化硅的岩漿热液渗入砂砾层中，产生硅化交代作用，把能变成玛瑙的砾石材料变成交代玛瑙，不能变成玛瑙则成为各种硅化岩石。沒有后期的硅化交代作用，就不能形成雨花石，只能称为河成砾石或水冲石（观赏石或宝玉石为仔料）。硅化是有沒有雨花石不可缺少的条件。

江西、安徽及上海均有砾石层，前二个条件和南京条件相似，但砾石层形成后南京受新近纪玄武岩火山喷发影响发生強烈硅化作用成为雨花石的产地，其他地方因无岩漿活动，均不产雨花石。南京雨花石产地主要分布玄武岩作为盖层的六合、仪征的雨花台組砾石层中，而下蜀組作为盖层的雨花台組砾石虽也产过石，至少不算雨花石的主产地，这种現象应該和各地的硅化強度不同有关。